طيلة المدة التي أعقبت الاحتلال الأميركي للعراق في عام 2003، كانت وزارة التعليم العالي والبحث العلمي، نموذجا صارخا للسعار الطائفي في البلاد، ومازالت حتى الآن تظهر القرارات الإدارية الممارسات الطائفية للمسؤولين الشيعة الذين تولوا قيادتها.